Valtion talousarvioesityksessä vuodelle 2017 esitetään poistettavaksi momentti 29.40.52 (erityinen valtionrahoitus Helsingin yliopiston ja Itä-Suomen yliopiston opetus- ja tutkimustoimintaan). Määräraha oli vuonna 2014 29,144 miljoonaa euroa, vuonna 2015 30,299 miljoonaa euroa ja vuonna 2016 31,679 miljoonaa euroa. 

Määrärahan peruste on yliopistolain 75 ja 92 a pykälissä mainittu seuraavasti: "Valtio korvaa vuosittain yliopistolle määrän, joka vastaa yliopiston apteekkiliikkeen harjoittamisesta saadun elinkeinotulon perusteella maksettua yhteisöveroa. Valtio korvaa lisäksi vuosittain yliopistolle määrän, joka vastaa yliopiston apteekkiliikkeestä suoritettua apteekkimaksua." 

Kun valtionrahoitusta yliopistojen toimintamenoihin esitetään supistettavaksi n. 31,8 miljoonaa euroa, on ehdotettu määrärahan poisto vielä lisävähennys näille kahdelle yliopistolle. Erityisesti Itä-Suomen yliopistossa määrärahojen väheneminen heikentää merkittävästi opetus- ja tutkimustoimintaa, koska yliopiston mahdollisuus saada ulkopuolista rahoitusta mm. tilaustutkimusten kautta on koulutusalojen monipuolisuudesta huolimatta erityisen haasteellista.